As atividades da Escola de Educação Básica “Gertrud Aichinger” iniciaram no ano de 1981, nas dependências Salão Paroquial da Comunidade Católica, situado na rua Getúlio Vargas, nº 400, bairro centro, com o nome de Escola Básica Gertrud Aichinger.  Foi autorizado o seu funcionamento de 1ª a 4ª Série, pela Portaria E 050, de 17 de fevereiro de 1981, do Conselho Estadual de Educação (CEE),e de 5ª a 8ª Série, pela Portaria E 0132 de 23 de abril de 1981 do CEE.

No ano de 1984, a Escola Básica Gertrud Aichinger ganha um novo prédio, situado na rua Imbuia, nº 150 e passa a funcionar, além do Ensino Fundamental, com o Ensino Médio “Técnico em Administração”, autorizado pela Portaria 0076 de 06 de abril de 1984 e passa a ser denominada Colégio Gertrud Aichinger, reconhecido pelo Parecer nº 261/71 e Resolução 14/87.

Em 1987, o funcionamento do Curso “Técnico de Secretariado” foi autorizado pelo Parecer nº 269/87.

Em 1996 foram extintos os Cursos Profissionalizantes Técnico em Administração e Técnico de Secretariado, sendo implantado o PROFORT – Programa de Formação de Jovens para o Trabalho – com os cursos de Técnico em Processamento de Dados e Educação Geral.

Em 1998 foi extinto o PROFORT, ficando apenas o curso de Educação Geral.

Em 2.000 passou a denominar-se Escola de Educação Básica “Gertrud Aichinger”, mudança ocorrida em virtude da LDB.

Em 2001 ocorreu o reordenamento, tornando se uma escola jovem, onde passou a funcionar somente no Ensino Fundamental, as turmas de  8ª séries, e no Ensino Médio as 3ª séries referentes ao Curso de Educação Geral.

Em 2006, foi implantado o Curso de Educação Profissional Técnica de Nível Médio – Área de Gestão – Habilitação Técnico em Gestão de Propriedades Rurais, com duração de 4 (quatro) anos, conforme parecer nº 365 de 20/12/2005.

No ano de 2006/2007 a escola passou por uma reforma e readequação da construção mais antiga.